红冲发票操作流程：1.首先需要申请开具红字专用发票，向主管税务机关提交。2.税务机关根据纳税人提交的申请单，审核后，通过红字票通知单管理系统开具通知单。3.企业收到税务机关开具的通知单，可以在开票系统中开具红字专用发票。